Ένα από τα συνακόλουθα της κατοχής 1940-1944 ήταν και η συνεργασία ορισμένων πολιτών με τους εχθρούς, κατά την κατοχική περίοδο. Σε έγγραφό του ο Πρύτανης προς τον Διευθυντή του Σχολείου, με ημερομηνία 13 Σεπτεμβρίου 1945, ζητάει να ενημερωθεί εάν υπάρχουν στοιχεία που να αφορούν σε καθηγητές, βοηθούς, επιμελητές αλλά και βοηθητικό προσωπικό, το οποίο συνεργάσθηκε «μετά των εχθρών κατά την περίοδον της εχθρικής κατοχής της χώρας».